Kwalifikowany podpis elektroniczny można wykorzystywać między innymi do:
- pozyskiwania wypisów elektronicznych dotyczących wszystkich podmiotów gospodarczych wpisanych do Krajowego Rejestru Sądowego (KRS) czyli np. do podpisywania dokumentów i wniosków o rejestrację spółki, zmiany aktualizacyjne danych w spółkach itp.
- składania formularzy do KIO (Krajowej Izby Odwoławczej)
- składania pism procesowych w sądowym postępowaniu upominawczym,
- kontaktów drogą elektroniczną z Zakładem Ubezpieczeń Społecznych (ZUS), np.:podpisania wniosku o wydanie zaświadczenia o niezaleganiu ze składkami na ubezpieczenie społeczne, podpisania deklaracji,
- nadawania mocy prawnej dokumentom w kontaktach prawnych przez Internet (np. upoważnienia elektroniczne w ZUS),
- podpisywania urzędowej korespondencji z podmiotami administracji publicznej za pośrednictwem elektronicznej skrzynki podawczej,
- składania e-deklaracji podatkowych (www.e-deklaracje.gov.pl),
- zawierania umów cywilno-prawnych w formie elektronicznej,
- wystawiania faktur w formie elektronicznej,
- uczestniczenia w aukcjach i przetargach elektronicznych (np. www.e-przetarg.pl),
- podpisywania raportów do Generalnego Inspektora Informacji Finansowej (GIIF),
- zgłaszania drogą elektroniczną zbiorów danych osobowych do Generalnego Inspektora Ochrony Danych Osobowych (GIODO),
- składania e-deklaracji do Ubezpieczeniowego Funduszu Gwarancyjnego (UFG),
- nadawania elektronicznym odpisom i zaświadczeniem wydawanym przez Centralną Informację o Zastawach Rejestrowych, mocy prawnej dokumentów urzędowych,
- składania drogą elektroniczną do Polskiej Agencji Rozwoju Przedsiębiorczości (PARP) wniosków o dotacje unijne,
- wystawiania, podpisywania i przesyłania faktur VAT RR w formie elektronicznej,
- sporządzanie Jednolitego Europejskiego Dokumentu Zamówienia,
- składanie wniosku o udział w e-przetargach publicznych.